技术需求
(*)用途
主要用于全基因组测序、转录组测序、微生物宏基因组测序,靶向测序、遗传病测序、肿瘤测序等。
(*)技术参数
1.可通过电脑端操作也可直接通过触控屏操作设备。
2.测序仪可进行*级分析,输出*****原始文件及测序质量分析等测序信息。
3.测序仪可满足未知感染宏基因组测序、分型及溯源等应用。
4.支持自动单端测序和双端测序,配合光学检测技术。
5.测序试剂预置,*键加液,测序清洗试剂*体化,自带清洗维护程序,测序结束后自动清洗设备。
★6.测序仪采用双模设计,可根据实验需要选择单独、同时、滚动上样,单模块可提供≥***的r****数,双模块合计可提供≥****的r****数。
7.测序仪主机单次开机检测最高数据通量≥****。
8.测序仪主机操作系统及说明书语言:标配中文,测序仪主机操作系统中文和英文可选。
★9.测序仪基于线性扩增技术,每次扩增都以原始***单链环为模板,有效避免***扩增错误指数积累。
**.低标签跳跃:通过各项技术可有效降低标签跳跃,保证数据准确性。
★**.读长支持:支持读长类型至少应包括*****、*****、*****、*****,或更多类型。
**.测序时长:读长*****时测序时间≤5小时,整机最高产出数据量≥***;读长*****时测序时间≤**小时,整机最高产出数据量≥***。
**.数据质量:读长为****,数据质量***>**%;读长为*****,数据质量***>**%;读长≥*****,数据质量***>**%。
**.建库试剂方案完整,可提供与测序仪生产厂家同品牌的***、***文库制备试剂套装(建库试剂盒)同时支持开放试剂及耗材,并能提供现场技术支持(供应商须在投标文件中提供相应承诺函)。
★**.配备自动化样本制备系统,内置扩增仪,配备≥**通道移液器,单次运行支持≥**个样本文库制备,内置紫外消毒系统及空气洁净系统,可自动化实现扩增及纯化等建库流程。
**.自动化样本制备系统,支持移液体积范围 2 **-*** **范围, 移液分辨率≤0.***。加样精度:**≤5%(2μl时),准确度:&**;±**%; **≤1%(***μl时),准确度:&**;±1%。
★**.配备外置本地化服务器,至少满足内存***** ****,固态硬盘***+*****,机械硬盘****。服务器内置中文微生物快速识别软件、微生物组装溯源软件、新冠病毒分析软件,软件更新时可提供本地更新。
**.微生物快速识别软件可进行宏转录组数据分析、宏基因组数据分析,以及***/*** 数据共分析,对原始样本中的微生物核酸序列进行分析和鉴定,并自动生成鉴定结果和分析报告。
**.微生物快速识别软件内置物种数据库,包括**种以上的宿主物种,人、猪、山羊、绵羊、小鼠等;同时,支持定制化开发更多宿主物种。
**.微生物快速识别软件收录不低于2*种微生物,涵盖细菌、真菌、病毒、寄生虫及古生菌等。
**.微生物组装溯源软件,包含多个分析模块可对细菌、真菌、病毒等病原微生物的测序数据,实现从测序下机数据到基因组组装、系统进化分析,并自动计算变异检测结果供研究参考。
**.新冠病毒分析软件,可进行多重***打断技术测序数据的分析。包含数据质控、组装、变异注释、分型、溯源功能,测序完成后可自动传输数据并分析。
★**.配备中文遗传病测序、肿瘤测序分析软件,分析软件可进行遗传变异检测与分析,实现碱基质量分数校正、体细胞突变检测功能。
**.遗传病测序、肿瘤测序分析软件具备质控功能,用于去除低质量序列、接头及杂质,可产生包含碱基质量分布、**含量、接头污染等详尽指标的报告。具备序列比对功能,可将*代测序产生的*****高效映射到参考基因组上。
**. 遗传病测序、肿瘤测序分析软件具备注释变异的功能效应,结合数据库信息解析变异数据,提供变异功能性影响、基因定位及已知突变匹配的内容。
**.配备荧光计,用于测序质控,至少满足测量范围***-**** **,处理时间:≤5 秒/样品。
**.配备磁力架,用于磁珠纯化等过程,至少满足**个标准孔位。
**.配备振荡器及微型离心机,用于测序样品前处理。振荡器至少满足振动与旋涡混合方式,转速≥****转/分,微型离心机至少满足1.5/***离心管的沉淀或离心,转速≥*****转/分。
(*)配置
1.基因测序仪 1台
2.自动化样本制备系统 1台
3.本地化服务器 1台
4.微生物快速识别软件 1套
5.微生物组装溯源软件 1套
6.新冠病毒分析软件 1套
7.遗传病测序和肿瘤测序分析软件 1套
8.荧光计 1台
9.测试荧光计所需试剂 1套
**.磁力架 1套
**.振荡器 1台
**.微型离心机 1台
★**.配备必要测试及培训试剂(**人份/套)
**.1开机测试试剂1套
**.2测序技术全流程培训所需新冠检测试剂3套,细菌全基因组检测试剂1套